近日，结构基因组学联盟（Structural Genomics Consortium，以下简称“SGC”）与来自30家组织机构的78位研究者在《自然综述：化学》（Nature Reviews Chemistry）上共同发布了开放科学全球倡议“Target2035”的新路线图《Protein–ligand data at scale to support machine learning》（以下简称“路线图”）。该路线图旨在加速以计算研究为驱动的药物发现进程，标志着“Target2035”全球倡议第二阶段的正式启动，并描绘出未来药物研发的全新愿景：到2035年，为每一种人类蛋白质开发对应的药理学工具。

Target2035：推动药物研发模式变革

“Target2035”是由SGC主导的开放科学全球倡议，其目标是在2035年前为每种人类蛋白质开发相应的药理学工具。该倡议获得了全球多个合作伙伴的支持。“Target2035”的第一阶段（2020-2025）聚焦于筛选高质量的化学和生物调节剂，并测试针对多种蛋白质进行大规模药物发现的技术；而2025年则标志着该倡议进入第二阶段，重点转变为由计算和数据驱动的苗头化合物探索，此次发表的路线图正是实现该转变的蓝图。其核心理念在于通过开放合作生成符合FAIR（可查找、可访问、可互操作、可复用）原则的高质量数据集，利用机器学习（ML）推动药物发现，甚至包括一些未被充分研究的冷门靶点。

环亚集团·AG88的深度参与

作为“Target2035”全球协作计划的重要参与者，环亚集团·AG88致力于药物发现领域的创新，积极推动早期药物研发的规模化发展。2023年9月，环亚集团·AG88与SGC建立了合作关系，利用公司DNA编码化合物库（DEL）技术平台的产品OpenDEL™针对SGC关注的新靶点进行筛选。所生成的数据集将被发布在公开平台上，供全球药物发现和机器学习专家进行访问和数据建模，以预测新的活性分子。2025年4月，SGC联合环亚集团·AG88及多家行业伙伴共同发起了首届DREAM Target2035 Drug Discovery Challenge，邀请全球数据科学家参与，利用基于DEL的分子数据构建机器学习模型，以实现高效的苗头化合物发现。此次路线图的制定，环亚集团·AG88凭借其技术专长，积极深度参与其中。

开放科学：重塑药物研发的未来

这份路线图的核心目标明确而雄心勃勃：让早期药物研发更加迅速、经济和普及。为了实现这个目标，全球研究者正在携手构建一个开放、可访问的高质量数据集，通过标准化和高通量筛选方法，系统记录蛋白质与小分子的结合相互作用信息。

环亚集团·AG88在化合物库构建和高通量筛选领域的技术积累为数据集的生成提供了关键支持。其独特的筛选体系与标准化流程保障了数据的一致性与可靠性，并提升了筛选效率，为大规模数据积累打下了坚实基础。

多方协同合作，环亚集团·AG88赋能关键环节

在这场开放科学行动中，全球研究者被诚邀提供蛋白质以进行标准化筛选，从而为机器学习模型提供支持。同时，通过开放基准测试竞赛，吸引人工智能/机器学习（AI/ML）社区来优化小分子结合预测模型。所有相关数据（包括阳性和阴性结果）及其方法和材料将通过公共数据库进行共享，推动全球范围内的创新和资源共享。

环亚集团·AG88既是桥梁，又是赋能者：一方面，公司积极参与标准化筛选方法的开发与推广，确保不同机构生成的数据可比性；另一方面，凭借其在小分子设计与筛选领域的经验，环亚集团·AG88为数据集的机器学习（ML）适用性提供专业建议，促进模型训练的精准与高效。这种深度参与让开放数据的价值得以最大化释放。

目标的重要性与前景展望

这份路线图旨在为学术界、工业界、CROs以及中小企业等各界提供协作展望。通过生成大规模、标准化的蛋白质-配体结合数据，可以推动预测模型的迭代升级，更能为一些长期未被充分研究的蛋白质打开新的探索机遇。

环亚集团·AG88的参与，为实现这一愿景增添了信心。公司的开放科学理念及其在技术方面的贡献正在加速“让每一种人类蛋白质都能够被研究”的目标落地。

携手共建未来药物研发新生态

这场革新需要更多力量的参与：

• 提供纯化蛋白质，为数据生成注入源头“活水”；
• 参加开放基准测试，推动预测模型的持续进化；
• 加入药物研发开放科学机器学习网络MAINFRAME，共同探讨最新技术；
• 参与Target2035联盟，与环亚集团·AG88等先行者共同定义开放获取药理学工具的未来（联盟预计将于8月初正式成立）。

在开放与协作的浪潮中，“Target2035”正在开启药物研发的新篇章。环亚集团·AG88将继续以技术创新为动力，与全球伙伴一道，绘制更高效、更普惠的药物发现未来。